Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIF1Q5UIP0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms