Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms