Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SOGA3Q5TF21 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOGA3Q5TF21 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOGA3Q5TF21 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOGA3Q5TF21 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOGA3Q5TF21 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOGA3Q5TF21 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOGA3Q5TF21 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms