Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms