Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITRM1Q5JRX3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms