Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.1 ms