Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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