Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms