Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDO1Q16878 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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