Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCK2Q16822 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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