Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSRP2Q16527 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSRP2Q16527 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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