Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC6Q16204 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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