Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZFHX3Q15911 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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