Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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