Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCOLCEQ15113 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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