Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LAPTM4AQ15012 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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