Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NCAPHQ15003 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPHQ15003 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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