Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
GAPVD1Q14C86 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GAPVD1Q14C86 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GAPVD1Q14C86 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
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