Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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