Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COTL1Q14019 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms