Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2H3Q13889 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF2H3Q13889 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms