Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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