Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
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SHROOM2Q13796 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
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SHROOM2Q13796 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
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SHROOM2Q13796 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SHROOM2Q13796 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
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SHROOM2Q13796 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SHROOM2Q13796 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
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SHROOM2Q13796 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
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SHROOM2Q13796 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
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SHROOM2Q13796 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHROOM2Q13796 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
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SHROOM2Q13796 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
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SHROOM2Q13796 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHROOM2Q13796 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
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SHROOM2Q13796 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SHROOM2Q13796 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
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