Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA4Q13772 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA4Q13772 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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