Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
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