Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms