Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP140Q13342 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP140Q13342 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP140Q13342 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP140Q13342 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP140Q13342 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP140Q13342 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP140Q13342 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP140Q13342 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP140Q13342 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP140Q13342 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SP140Q13342 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SP140Q13342 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SP140Q13342 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SP140Q13342 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SP140Q13342 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SP140Q13342 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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SP140Q13342 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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SP140Q13342 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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SP140Q13342 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SP140Q13342 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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SP140Q13342 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SP140Q13342 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP140Q13342 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SP140Q13342 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SP140Q13342 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SP140Q13342 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SP140Q13342 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SP140Q13342 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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