Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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IFT88Q13099 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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IFT88Q13099 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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IFT88Q13099 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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IFT88Q13099 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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IFT88Q13099 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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IFT88Q13099 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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IFT88Q13099 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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IFT88Q13099 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
IFT88Q13099 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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