Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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