Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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