Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRJQ12913 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms