Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNTN1Q12860 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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