Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TROQ12816 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TROQ12816 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TROQ12816 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TROQ12816 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TROQ12816 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TROQ12816 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TROQ12816 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TROQ12816 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TROQ12816 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TROQ12816 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TROQ12816 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROQ12816 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROQ12816 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROQ12816 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROQ12816 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROQ12816 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROQ12816 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROQ12816 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROQ12816 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROQ12816 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROQ12816 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TROQ12816 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TROQ12816 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TROQ12816 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TROQ12816 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TROQ12816 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TROQ12816 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TROQ12816 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TROQ12816 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TROQ12816 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TROQ12816 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TROQ12816 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TROQ12816 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TROQ12816 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TROQ12816 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TROQ12816 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TROQ12816 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TROQ12816 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROQ12816 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROQ12816 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROQ12816 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROQ12816 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROQ12816 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TROQ12816 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROQ12816 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROQ12816 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROQ12816 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROQ12816 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROQ12816 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROQ12816 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROQ12816 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROQ12816 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROQ12816 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROQ12816 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROQ12816 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROQ12816 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROQ12816 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROQ12816 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROQ12816 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROQ12816 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROQ12816 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TROQ12816 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
TROQ12816 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TROQ12816 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
TROQ12816 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TROQ12816 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TROQ12816 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TROQ12816 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TROQ12816 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TROQ12816 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TROQ12816 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
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