Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXO1Q12778 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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FOXO1Q12778 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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FOXO1Q12778 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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