Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 CAP1YKL007W 807 nt1.53□□□□□ -2.16
RTR2Q12378 YKL069WYKL069W 543 nt1.53□□□□□ -2.16
RTR2Q12378 PDR17YNL264C 1053 nt1.53□□□□□ -2.16
RTR2Q12378 HMS1YOR032C 1305 nt1.53□□□□□ -2.16
RTR2Q12378 DSE3YOR264W 1293 nt1.53□□□□□ -2.16
RTR2Q12378 RPL11AYPR102C 525 nt1.53□□□□□ -2.16
RTR2Q12378 NCB2YDR397C 441 nt1.52□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 AIM18YHR198C 966 nt1.52□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 AIM4YBR194W 372 nt1.52□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 TDA9YML081W 3756 nt1.52□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 SAC3YDR159W 3906 nt1.51□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 IZH1YDR492W 951 nt1.51□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.51□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 SEC4YFL005W 648 nt1.51□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YGL069CYGL069C 465 nt1.51□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YLR400WYLR400W 474 nt1.51□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YAP7YOL028C 738 nt1.51□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 PFK27YOL136C 1194 nt1.51□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YPL039WYPL039W 951 nt1.51□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 RTT101YJL047C 2529 nt1.5□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 CBF2YGR140W 2871 nt1.5□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 SHU2YDR078C 672 nt1.5□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 RNH202YDR279W 1053 nt1.5□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 TPK3YKL166C 1197 nt1.5□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YIM2YMR151W 438 nt1.5□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 FYV12YOR183W 390 nt1.5□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 CHS1YNL192W 3396 nt1.5□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YJR098CYJR098C 1971 nt1.5□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 SPC110YDR356W 2835 nt1.49□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 AVT5YBL089W 1380 nt1.49□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YCR099CYCR099C 468 nt1.49□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 CTH1YDR151C 978 nt1.49□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YBR197CYBR197C 654 nt1.49□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 POM152YMR129W 4014 nt1.49□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YEL1YBL060W 2064 nt1.49□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YEL043WYEL043W 2871 nt1.49□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 NPR3YHL023C 3441 nt1.49□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 CCH1YGR217W 6120 nt1.48□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 MYO4YAL029C 4416 nt1.48□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 ADK1YDR226W 669 nt1.48□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YKL071WYKL071W 771 nt1.48□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 RPC40YPR110C 1008 nt1.48□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 HSL1YKL101W 4557 nt1.47□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 RPF2YKR081C 1035 nt1.47□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 ECI1YLR284C 843 nt1.47□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 PIN3YPR154W 648 nt1.47□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 YSA1YBR111C 696 nt1.47□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 FYV8YGR196C 2454 nt1.47□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 POL5YEL055C 3069 nt1.47□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 PET127YOR017W 2403 nt1.47□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 VPS9YML097C 1356 nt1.47□□□□□ -2.17
RTR2Q12378 PKP2YGL059W 1476 nt1.46□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 RUD3YOR216C 1455 nt1.46□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 SPO12YHR152W 522 nt1.46□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 CSM2YIL132C 642 nt1.46□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YJL169WYJL169W 369 nt1.46□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 MRPS17YMR188C 714 nt1.46□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 LTP1YPR073C 486 nt1.46□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 TFB1YDR311W 1929 nt1.46□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YJL070CYJL070C 2667 nt1.45□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 DNF3YMR162C 4971 nt1.45□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 RTG3YBL103C 1461 nt1.45□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 ATP17YDR377W 306 nt1.45□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YGL024WYGL024W 336 nt1.45□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YLR444CYLR444C 303 nt1.45□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 HRT1YOL133W 366 nt1.45□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 TRM7YBR061C 933 nt1.45□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 GRX1YCL035C 333 nt1.45□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 BIT61YJL058C 1632 nt1.44□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 SPO77YLR341W 1434 nt1.44□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 MAL33YBR297W 1407 nt1.44□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.44□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 NCE101YJL205C 162 nt1.44□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YLR302CYLR302C 363 nt1.44□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 HCS1YKL017C 2052 nt1.44□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 MSH6YDR097C 3729 nt1.44□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 APC2YLR127C 2562 nt1.44□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YKR015CYKR015C 1707 nt1.43□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 SDC1YDR469W 528 nt1.43□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 PEX21YGR239C 867 nt1.43□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt1.43□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.43□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YBL077WYBL077W 432 nt1.43□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 SSP2YOR242C 1116 nt1.43□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YRO2YBR054W 1035 nt1.43□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 RGA2YDR379W 3030 nt1.43□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 URB2YJR041C 3525 nt1.43□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 SLF1YDR515W 1344 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YNR066CYNR066C 1311 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 KAR5YMR065W 1515 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 BPH1YCR032W 6504 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 TAN1YGL232W 870 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 ACB1YGR037C 264 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YGR064WYGR064W 369 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YLR290CYLR290C 834 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 SEN15YMR059W 387 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 VTI1YMR197C 654 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 MED8YBR193C 672 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 MDM10YAL010C 1482 nt1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64.6 ms