Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YER138CYER138C 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YER160CYER160C 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YJR027WYJR027W 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YML039WYML039W 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YML045WYML045W 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YMR050CYMR050C 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.7□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 PBS2YJL128C 2007 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 PSY2YNL201C 2577 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 SWC4YGR002C 1431 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 MRS2YOR334W 1413 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 MMS1YPR164W 4224 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 SKT5YBL061C 2091 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 ALY1YKR021W 2748 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 OPI6YDL096C 327 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 DTD1YDL219W 453 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YHR054CYHR054C 1065 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 NIP7YPL211W 546 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 UBX3YDL091C 1368 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 TOM1YDR457W 9807 nt2.69□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 FLO11YIR019C 4104 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YKL222CYKL222C 2118 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 snR9snR9 187 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YDR115WYDR115W 318 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 TIM11YDR322C-A 291 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 FAR7YFR008W 666 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 RPL8BYLL045C 771 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 SDO1YLR022C 753 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YPR014CYPR014C 330 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YPR203WYPR203W 309 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 MUD1YBR119W 897 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 NCS2YNL119W 1482 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 ICR1ICR1 3199 nt2.68□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 JJJ1YNL227C 1773 nt2.67□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 RAX2YLR084C 3663 nt2.67□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 PRP38YGR075C 729 nt2.67□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YAL037WYAL037W 804 nt2.67□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YMR254CYMR254C 309 nt2.67□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YAP7YOL028C 738 nt2.67□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.67□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 CSM4YPL200W 471 nt2.67□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 TPK2YPL203W 1143 nt2.67□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 JSN1YJR091C 3276 nt2.67□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YLR446WYLR446W 1302 nt2.67□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 BPT1YLL015W 4680 nt2.66□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 MFB1YDR219C 1398 nt2.66□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 MRH1YDR033W 963 nt2.66□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 RPL27AYHR010W 411 nt2.66□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YJR087WYJR087W 351 nt2.66□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 MRP49YKL167C 414 nt2.66□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.66□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 MSN1YOL116W 1149 nt2.66□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YPR153WYPR153W 423 nt2.66□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 FUN30YAL019W 3396 nt2.66□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 YRR1YOR162C 2433 nt2.66□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 POM152YMR129W 4014 nt2.65□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 NEL1YHR035W 1893 nt2.65□□□□□ -1.98
VAM3Q12241 snR59snR59 78 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 YDR018CYDR018C 1191 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 OCA6YDR067C 675 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 FIN1YDR130C 876 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 VMA21YGR105W 234 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 PEX18YHR160C 852 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 YJL119CYJL119C 324 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 ACF4YJR083C 930 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 YNL150WYNL150W 408 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 RRG8YPR116W 834 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 CTF13YMR094W 1437 nt2.65□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 SHE4YOR035C 2370 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 SDH3YKL141W 597 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 YLR224WYLR224W 1110 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 ILV5YLR355C 1188 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 ATP18YML081C-A 180 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 IRC21YMR073C 606 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 BFR1YOR198C 1413 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 DBP7YKR024C 2229 nt2.64□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 MOT1YPL082C 5604 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 NCB2YDR397C 441 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 RPS26BYER131W 360 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 YMR31YFR049W 372 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 Q0144Q0144 330 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 YLR271WYLR271W 825 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 PDP3YLR455W 915 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 YOR169CYOR169C 465 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 RRD2YPL152W 1077 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 MES1YGR264C 2256 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 TRZ1YKR079C 2517 nt2.63□□□□□ -1.99
VAM3Q12241 APC2YLR127C 2562 nt2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.8 ms