Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACSM1Q08AH1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACSM1Q08AH1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACSM1Q08AH1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACSM1Q08AH1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACSM1Q08AH1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACSM1Q08AH1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACSM1Q08AH1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACSM1Q08AH1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACSM1Q08AH1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACSM1Q08AH1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACSM1Q08AH1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACSM1Q08AH1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms