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Protein–RNA interactions for Protein: Q08490
SGO1, Shugoshin, yeast
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590 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SGO1
Q08490
PRP22
YER013W
3438 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YGR027W-B
YGR027W-B
5268 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YLR227W-B
YLR227W-B
5268 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YPR158C-D
YPR158C-D
5268 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
RDS1
YCR106W
2499 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
ALA1
YOR335C
2877 nt
3.65
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
LCB5
YLR260W
2064 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
OPI6
YDL096C
327 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YIL046W-A
YIL046W-A
165 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YAL064W-B
YAL064W-B
381 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
RNH203
YLR154C
333 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
ARG80
YMR042W
534 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YBL039W-B
YBL039W-B
180 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YMR304C-A
YMR304C-A
351 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
RPL16B
YNL069C
597 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
SFM1
YOR021C
642 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
HRD1
YOL013C
1656 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
ISM1
YPL040C
3009 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YBR012W-A
YBR012W-A
1323 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YOR142W-A
YOR142W-A
1323 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YPR158W-A
YPR158W-A
1323 nt
3.64
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
SSF2
YDR312W
1362 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
SSM4
YIL030C
3960 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
SCY1
YGL083W
2415 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YLR352W
YLR352W
2424 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YJR030C
YJR030C
2238 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
SRP68
YPL243W
1800 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
MSL5
YLR116W
1431 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
SEG1
YMR086W
2883 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YDR464C-A
YDR464C-A
189 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YGL074C
YGL074C
327 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
REC104
YHR157W
549 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YKL068W-A
YKL068W-A
237 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YKL136W
YKL136W
399 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
RFC3
YNL290W
1023 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
LDS2
YOL047C
1071 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
CDC45
YLR103C
1953 nt
3.63
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
FMN1
YDR236C
657 nt
3.62
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
PHM6
YDR281C
315 nt
3.62
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
RPS8B
YER102W
603 nt
3.62
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YGL015C
YGL015C
393 nt
3.62
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
PDX1
YGR193C
1233 nt
3.62
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
RPB3
YIL021W
957 nt
3.62
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
RRT16
YNL105W
429 nt
3.62
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YOL134C
YOL134C
390 nt
3.62
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
VAC14
YLR386W
2643 nt
3.62
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
AKR1
YDR264C
2295 nt
3.61
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
ARG5,6
YER069W
2592 nt
3.61
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
UTP15
YMR093W
1542 nt
3.61
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
NRP1
YDL167C
2160 nt
3.61
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YLR177W
YLR177W
1887 nt
3.61
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
MUB1
YMR100W
1863 nt
3.61
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
GRX2
YDR513W
432 nt
3.61
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YLR269C
YLR269C
351 nt
3.61
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
BSC3
YLR465C
309 nt
3.61
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
SEN54
YPL083C
1404 nt
3.61
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
IMH1
YLR309C
2736 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
IMD4
YML056C
1575 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
APL4
YPR029C
2499 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
SNA4
YDL123W
423 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YEL057C
YEL057C
702 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YJR079W
YJR079W
330 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
CGI121
YML036W
546 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
DYN3
YMR299C
939 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
NOP15
YNL110C
663 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
PDR17
YNL264C
1053 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
PEP12
YOR036W
867 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YOR231C-A
YOR231C-A
201 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
IRC16
YPR038W
360 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
PEX5
YDR244W
1839 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
SSF1
YHR066W
1362 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
EAP1
YKL204W
1899 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
SPE1
YKL184W
1401 nt
3.6
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
SSE2
YBR169C
2082 nt
3.59
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YPS6
YIR039C
1614 nt
3.59
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YNL193W
YNL193W
1677 nt
3.59
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
CDC26
YFR036W
375 nt
3.59
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
FYV4
YHR059W
393 nt
3.59
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
MBB1
YJL199C
327 nt
3.59
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
YAF9
YNL107W
681 nt
3.59
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
CDC33
YOL139C
642 nt
3.59
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
FAT1
YBR041W
2010 nt
3.59
□□□□□ -1.83
SGO1
Q08490
RIM13
YMR154C
2184 nt
3.59
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YDR089W
YDR089W
2610 nt
3.58
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
KAR9
YPL269W
1935 nt
3.58
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
tF(GAA)D
tF(GAA)D
73 nt
3.58
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
tF(GAA)N
tF(GAA)N
73 nt
3.58
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YDR431W
YDR431W
312 nt
3.58
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
EMI1
YDR512C
564 nt
3.58
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
TMA19
YKL056C
504 nt
3.58
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
APC9
YLR102C
798 nt
3.58
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
PKR1
YMR123W
369 nt
3.58
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YOR277C
YOR277C
309 nt
3.58
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YPL038W-A
YPL038W-A
192 nt
3.58
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
SHQ1
YIL104C
1524 nt
3.58
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
RNR1
YER070W
2667 nt
3.57
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
SDC1
YDR469W
528 nt
3.57
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
ECO1
YFR027W
846 nt
3.57
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
BI4
Q0120
1917 nt
3.57
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
SMI1
YGR229C
1518 nt
3.57
□□□□□ -1.84
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