Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 PRP22YER013W 3438 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 RDS1YCR106W 2499 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 ALA1YOR335C 2877 nt3.65□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 LCB5YLR260W 2064 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 OPI6YDL096C 327 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 RNH203YLR154C 333 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 ARG80YMR042W 534 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 RPL16BYNL069C 597 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 SFM1YOR021C 642 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 HRD1YOL013C 1656 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 ISM1YPL040C 3009 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt3.64□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 SSF2YDR312W 1362 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 SSM4YIL030C 3960 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 SCY1YGL083W 2415 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YLR352WYLR352W 2424 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YJR030CYJR030C 2238 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 SRP68YPL243W 1800 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 MSL5YLR116W 1431 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 SEG1YMR086W 2883 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YGL074CYGL074C 327 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 REC104YHR157W 549 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YKL136WYKL136W 399 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 RFC3YNL290W 1023 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 LDS2YOL047C 1071 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 CDC45YLR103C 1953 nt3.63□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 FMN1YDR236C 657 nt3.62□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 PHM6YDR281C 315 nt3.62□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 RPS8BYER102W 603 nt3.62□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YGL015CYGL015C 393 nt3.62□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 PDX1YGR193C 1233 nt3.62□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 RPB3YIL021W 957 nt3.62□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 RRT16YNL105W 429 nt3.62□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YOL134CYOL134C 390 nt3.62□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 VAC14YLR386W 2643 nt3.62□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 AKR1YDR264C 2295 nt3.61□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 ARG5,6YER069W 2592 nt3.61□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 UTP15YMR093W 1542 nt3.61□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 NRP1YDL167C 2160 nt3.61□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YLR177WYLR177W 1887 nt3.61□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 MUB1YMR100W 1863 nt3.61□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 GRX2YDR513W 432 nt3.61□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YLR269CYLR269C 351 nt3.61□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 BSC3YLR465C 309 nt3.61□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 SEN54YPL083C 1404 nt3.61□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 IMH1YLR309C 2736 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 IMD4YML056C 1575 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 APL4YPR029C 2499 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 SNA4YDL123W 423 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YEL057CYEL057C 702 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YJR079WYJR079W 330 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 CGI121YML036W 546 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 DYN3YMR299C 939 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 NOP15YNL110C 663 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 PDR17YNL264C 1053 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 PEP12YOR036W 867 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 IRC16YPR038W 360 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 PEX5YDR244W 1839 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 SSF1YHR066W 1362 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 EAP1YKL204W 1899 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 SPE1YKL184W 1401 nt3.6□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 SSE2YBR169C 2082 nt3.59□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YPS6YIR039C 1614 nt3.59□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YNL193WYNL193W 1677 nt3.59□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 CDC26YFR036W 375 nt3.59□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 FYV4YHR059W 393 nt3.59□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 MBB1YJL199C 327 nt3.59□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 YAF9YNL107W 681 nt3.59□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 CDC33YOL139C 642 nt3.59□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 FAT1YBR041W 2010 nt3.59□□□□□ -1.83
SGO1Q08490 RIM13YMR154C 2184 nt3.59□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 YDR089WYDR089W 2610 nt3.58□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 KAR9YPL269W 1935 nt3.58□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.58□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.58□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 YDR431WYDR431W 312 nt3.58□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 EMI1YDR512C 564 nt3.58□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 TMA19YKL056C 504 nt3.58□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 APC9YLR102C 798 nt3.58□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 PKR1YMR123W 369 nt3.58□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 YOR277CYOR277C 309 nt3.58□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt3.58□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 SHQ1YIL104C 1524 nt3.58□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 RNR1YER070W 2667 nt3.57□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 SDC1YDR469W 528 nt3.57□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 ECO1YFR027W 846 nt3.57□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 BI4Q0120 1917 nt3.57□□□□□ -1.84
SGO1Q08490 SMI1YGR229C 1518 nt3.57□□□□□ -1.84
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