Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLEQ07864 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLEQ07864 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLEQ07864 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLEQ07864 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLEQ07864 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLEQ07864 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLEQ07864 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLEQ07864 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLEQ07864 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLEQ07864 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLEQ07864 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLEQ07864 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLEQ07864 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLEQ07864 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLEQ07864 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLEQ07864 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLEQ07864 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLEQ07864 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms