Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFF3Q07654 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms