Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4BQ07343 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4BQ07343 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms