Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL9Q07325 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL9Q07325 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms