Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL16A1Q07092 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL16A1Q07092 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms