Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX4Q06945 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX4Q06945 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms