Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPAQ06546 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms