Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CALD1Q05682 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms