Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms