Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP1Q04837 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP1Q04837 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms