Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN1Q04323 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms