Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAP2Q03519 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAP2Q03519 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms